Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms