Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn8Q9Z260 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms