Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms