Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skp2Q9Z0Z3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms