Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb6Q9Z0T9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms