Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PapolbQ9WVP6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PapolbQ9WVP6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms