Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap4s1Q9WVL1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms