Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVC5

Trpc7, Short transient receptor potential channel 7, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc7Q9WVC5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Trpc7Q9WVC5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc7Q9WVC5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Trpc7Q9WVC5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Trpc7Q9WVC5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Trpc7Q9WVC5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Trpc7Q9WVC5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Trpc7Q9WVC5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Trpc7Q9WVC5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Trpc7Q9WVC5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc7Q9WVC5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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