Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slit3Q9WVB4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms