Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx1Q9WV80 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms