Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnip1Q9WUU8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnip1Q9WUU8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms