Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6cQ9WTM3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema6cQ9WTM3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms