Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TapbpQ9R233 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms