Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psma4Q9R1P0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma4Q9R1P0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms