Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrpxQ9R0M3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms