Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b2Q9R0K7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b2Q9R0K7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms