Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Plod3Q9R0E1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms