Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc3Q9QZC1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms