Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phtf1Q9QZ09 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phtf1Q9QZ09 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phtf1Q9QZ09 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Phtf1Q9QZ09 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phtf1Q9QZ09 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phtf1Q9QZ09 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phtf1Q9QZ09 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phtf1Q9QZ09 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms