Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms