Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr2e3Q9QXZ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms