Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms