Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpsf3Q9QXK7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf3Q9QXK7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms