Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad18Q9QXK2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad18Q9QXK2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms