Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms