Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc2lQ9JME7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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