Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upk3aQ9JKX8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms