Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrac1Q9JKP8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms