Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin1Q9JKF6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms