Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms