Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms