Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Praf2Q9JIG8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Praf2Q9JIG8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Praf2Q9JIG8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Praf2Q9JIG8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Praf2Q9JIG8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Praf2Q9JIG8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Praf2Q9JIG8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Praf2Q9JIG8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms