Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2ird1Q9JI57 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms