Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tnfrsf13bQ9ET35 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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