Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms