Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chrnb2Q9ERK7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms