Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dap3Q9ER88 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms