Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms