Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Barx1Q9ER42 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms