Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms