Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlr1Q9EPQ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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