Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms