Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan4Q9DCK3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Tspan4Q9DCK3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tspan4Q9DCK3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tspan4Q9DCK3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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