Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms