Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms