Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB27

Mcts1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcts1Q9DB27 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mcts1Q9DB27 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcts1Q9DB27 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Mcts1Q9DB27 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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