Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldnd2Q9D9H2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms