Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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