Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms