Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms